Som en del av svaret på den kontroversielle Abu Dhabi-tittelavgjørelsen forrige sesong, utnevnte FIA Niels Wittich og Eduardo Freitas til å erstatte Michael Masi som løpsdirektør.
Eks-DTM-løpsdirektør Wittich tok ansvar for starten av året i Bahrain før World Endurance Championships Freitas kom inn for Spanias og Monacos Grand Prix.
Wittich har truffet søkelyset for Baku etter å ha skissert endringer i reglene for inn- og utkjøring av pitlane, som nå lar sjåførene berøre de malte hvite linjene så lenge et fullt hjul ikke krysser.
Dette følger den mislykkede protesten fra Ferrari mot topprival Red Bull i Monaco, etter at både Max Verstappen og Sergio Perez ble regnet for å ha kysset linjene som gikk ut av gropene.
Dette kommer midt i klager på inkonsekvens fra det styrende organet, da det har forsøkt å påtvinge en mer hard linje holdning i sine forsøk på å reparere sin oppfatning etter Abu Dhabi.
Dette har særlig ført til en nedbryting av sjåfører som har på seg smykker i bilen, men unntak er gitt.
Da Magnussen torsdag ble spurt i Aserbajdsjan om han merket forskjell mellom kjennelsene til de to FIA-løpsdirektørene, sa han: «Jeg tror det har vært en forskjell».
Det, mente dansken, gjorde det vanskeligere å følge regelverket fullt ut.
Han fortsatte: «Kanskje det har blitt litt vanskeligere for øyeblikket å virkelig forstå hva reglene er. [They have] må bare prøve hardere å forstå det og snakke med gutta.
«Jeg tror det har vært mer konsekvent [in the past] enn det er akkurat nå. Det ville vært fint om deres holdning eller måten de tolker reglene på ville være helt konsistente.
Kevin Magnussen, Haas F1 Team
Foto av: Andy Hone / Bilsport bilder
«Så som sjåfør ville det vært lettere å forstå. Men det er dette vi har. Det er grunner til at de nye folkene kommer inn og skiftet i FIA.
«Jeg bekymrer meg ikke så mye om det. Dette er hva vi har. Det er som å bekymre seg for været. Jeg kan ikke endre det. Jeg prøver bare å takle det.»
I mellomtiden sa AlphaTauri-sjåføren Yuki Tsunoda til media: «Jeg stoler ikke på FIA. Hver gang er super inkonsekvent.
«For meg vil jeg bare holde meg til hva forskriften [says] eller bare det sikreste så mye som mulig, for ikke å få problemer.»
